1.原发单个靶腺功能减退出现单个靶器官功能减退的临床表现，实验室检查单个靶腺激素水平下降，相应垂体促激素水平升高，其他靶腺激素水平及促激素水平正常。
2.多发腺体衰竭综合征临床上出现多个靶腺功能原发衰竭，常合并其他自身免疫疾病如糖尿病、甲状旁腺功能减退等，主要的鉴别点为此综合征垂体促激素水平增高且无垂体占位病变的证据。
3.慢性消耗性疾病如肿瘤、肝病、结核、严重营养不良等，这些疾病可影响下丘脑释放激素的分泌，医'学教育网l整理导致不同程度的内分泌功能减退，但一般较轻，阴毛、腋毛不脱落，且有各自原发病的表现，可根据相应病史，体征，实验室检查加以鉴别。
4.神经性厌食可出现一系列内分泌功能的紊乱，但该病多为青年女性，有不正确的进食观念和审美观念，多有精神诱因，体重明显降低，血浆皮质醇水平升高，鉴别并不困难。
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